一、概念獨立核算與非獨立核算方式均為會計概念，采取哪一類會計核算方式應(yīng)由納稅人自行根據(jù)實際情況確定，稅務(wù)機關(guān)對此沒有要求。
二、非法人分支機構(gòu)是否獨立核算1.增值稅非法人分支機構(gòu)單獨繳納增值稅，如總機構(gòu)是小規(guī)模納稅人，分支機構(gòu)是一般納稅人，則分支機構(gòu)需要獨立核算的納稅人進行增值稅申報納稅?！咎嵝选可暾垖嵭性鲋刀悈R總申報納稅管理的納稅人，才會要求總機構(gòu)和分支機構(gòu)都必須是增值稅一般納稅人，因為增值稅一般納稅人和小規(guī)模納稅人的征收方式是不一樣的。
2.企業(yè)所得稅根據(jù)《中華人民共和國企業(yè)所得稅法》第五十條第二款規(guī)定：“居民企業(yè)在中國境內(nèi)設(shè)立不具有法人資格的營業(yè)機構(gòu)的，應(yīng)當(dāng)匯總計算并繳納企業(yè)所得稅?！狈欠ㄈ朔种C構(gòu)按照《國家稅務(wù)總局關(guān)于印發(fā)〈跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)所得稅征收管理辦法〉的公告》（國家稅務(wù)總局公告2012年第57號）規(guī)定，指總機構(gòu)、分支機構(gòu)應(yīng)按規(guī)定，分月或分季分別向所在地主管稅務(wù)機關(guān)申報預(yù)繳企業(yè)所得稅，或者依據(jù)第二十四條規(guī)定：“以總機構(gòu)名義進行生產(chǎn)經(jīng)營的非法人分支機構(gòu)，無法提供匯總納稅企業(yè)分支機構(gòu)所得稅分配表，也無法提供本辦法第二十三條規(guī)定相關(guān)證據(jù)證明其二級及以下分支機構(gòu)身份的，應(yīng)視同獨立納稅人計算并就地繳納企業(yè)所得稅，視同獨立納稅人的分支機構(gòu)，其獨立納稅人身份一個年度內(nèi)不得變更?！狈欠ㄈ朔种C構(gòu)視同獨立納稅人計算并就地繳納企業(yè)所得稅，都要求獨立核算。如果非法人分支機構(gòu)直接匯總總機構(gòu)繳納，不需要就地預(yù)繳的話，不考慮特殊情況下，稅務(wù)機關(guān)對是否獨立核算沒有要求。
3.印花稅
根據(jù)《國家稅務(wù)局關(guān)于印花稅若干具體問題的規(guī)定》(（1988）國稅地字第25號)規(guī)定：“跨地區(qū)經(jīng)營的分支機構(gòu)使用的營業(yè)賬簿，應(yīng)由各分支機構(gòu)在其所在地繳納印花稅。對上級單位核撥資金的分支機構(gòu)，其記載資金的賬簿按核撥的賬面資金數(shù)額計稅貼花，其他賬簿按定額貼花；對上級單位不核撥資金的分支機構(gòu)，只就其他賬簿按定額貼花。為避免對同一資金重復(fù)計稅貼花，上級單位記載資金的賬簿，應(yīng)按扣除撥給下屬機構(gòu)資金數(shù)額后的其余部分計稅貼花?！备鶕?jù)上述規(guī)定非法人分支機構(gòu)進行相關(guān)稅務(wù)登記，就應(yīng)該在其所在地繳納印花稅。4.其他稅種
關(guān)注其他稅種納稅地點的規(guī)定。