減少化肥的使用量和提高作物品質使用微生物肥料后對于提高農產品品質，如蛋白質、糖分、維生素等的含量上有一定作用，有的可以減少肖酸鹽的積累。在有些情況下，品質的改善比產量提高好處更大。有機肥料有機肥料（manure）天然有機質經微生物分解或發(fā)酵而成的一類肥料。中國又稱農家肥。其特點有：原料來源廣，數量大；養(yǎng)分全，含量低；肥效遲而長，須經微生物分解轉化后才能為植物所吸收；改土培肥效果好。常用的自然肥料品種有綠肥、人糞尿、廄肥、堆肥、漚肥、沼氣肥和廢棄物肥料等。

生物肥料的特點：微生物肥料是一類活菌制品，它的效能無不與其菌類活性及使用方法有直接的關系。（1）微生物肥料的核心是指品種特定的有效的活微生物，任何一款產品的有效活菌數都有明確的規(guī)定，精致生物有機肥，有效活菌數降到一定數量時，它的作用也就沒有了。（2）微生物肥料是一類農用活菌制劑，從生產到使用都要注意給產品中微生物一個生存的合適環(huán)境，主要是水分含量、酸堿度、溫度、載體中殘?zhí)呛?、包裝材料等等。（3）微生物肥料作為活菌制劑有一個有效期問題。此類產品剛生產出來時活菌含量較高，但隨著保存時間和不同的運輸、保存條件的變化，產品中的有效微生物數量逐漸減少，當減到一定數量時其有效作用顯示不出來。因此，規(guī)定產品的有效期和正確使用意義重大。（4）意適用作物和適用地區(qū)，是保證微生物肥料有效作用的重要保證。提倡有針對性地選育生產均種，例如針對堿性土壤、酸性土壤的均種，或是針對某特定作物的均種。

堆制方法，按原料的不同，分高溫堆肥和普通堆肥。高溫堆肥以纖維含量較高的植物物質為主要原料，在通氣條件下堆制發(fā)酵，產生大量熱量，堆內溫度高（50～60℃），精致生物有機肥，因而腐熟快，堆制快，養(yǎng)分含量高。高溫發(fā)酵過程中能殺其中的病菌、蟲卵和雜草種子。普通堆肥一般摻入較多泥土，發(fā)酵溫度低，腐熟過程慢，堆制時間長。堆制中使養(yǎng)分化學組成改變，碳氮比值降低，能被植物直接吸收的礦質營養(yǎng)成分增多，并形成腐殖質。

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