保稅區(qū)的功能十分強大，進一步說保稅區(qū)的功能跟中國香港的功能一樣，但是唯一的區(qū)別就是保稅區(qū)是在中國境內的區(qū)域，它是由海關監(jiān)管的區(qū)域。
貨物從國內進入保稅區(qū)視同出口，保稅區(qū)回到國內視同進口。
貨物從中國香港直接可以刷卡進入深圳保稅區(qū)無需辦理進口貨物手續(xù)。
深圳出口加工區(qū)不僅具有保稅區(qū)的功能而且還有深加工的功能，專業(yè)為出口企業(yè)提供一個很好的售后服務平臺，假如出口到國外的貨物，出現(xiàn)不良品需要返回國內維修深加工，坪山出口加工區(qū)則是的選擇。
坪山出口加工區(qū) 借助海關在深圳設立的檢測維修中心進行售后維修：
不需要辦理復雜的退運手續(xù)，只需要裝箱單、形式發(fā)票跟海關申報，不用原始單證；
無需向海關申請退運貨物協(xié)議, 免中檢，無需交納保證金方案。
流程：工廠將貨物經中國香港碼頭送進檢測維修保稅區(qū)倉庫（或者從鹽田碼頭轉關入?yún)^(qū)），廠方安排技術人員和配件以及檢測儀器到倉庫維修，改換包裝，改換完畢后裝柜直送中國香港碼頭或轉關鹽田碼頭出口。
相比傳統(tǒng)處理退運方式，優(yōu)劣勢分析：
(1)無須辦理復雜的退運手續(xù)，無需向海關申請退運貨物, 無需交納保證金。
(2) 復雜問題簡單化, 節(jié)約時間、成本. 特別從中國香港碼頭提貨到檢測保稅區(qū)（進區(qū)僅需打EDI單）只需3小時。